近年来，死棵问题，成为制约蔬菜发展的重要瓶颈。记者在采访时经常有菜农反映，苗子刚定植没几天就全棚上了病，到底是苗子带菌还是定植后染的病，很难说清楚。菜农接收苗子前后，正是苗子最为脆弱、易感染病虫害的时候。病害从侵染到发病都有一段较长的时间，一旦发病，再去防治难度较大，若提前做好了预防，就不会出现大量死棵的问题。
说到病害，茎叶部的病斑较为显著，菜农容易发现，发现后一般用药都很及时，但是对于根部病害，菜农往往是在发现棚中有幼苗死棵后才意识到。为了防住根部病害，减少死棵的发生，生产中菜农可采取定植前蘸盘、定植后灌药的办法来进行预防。
定植时的蘸盘是防治根部病害的第一步。目前市面上能够蘸盘的产品品种类型很多，一般来说，用于蘸盘的药剂大致上可以分为四类：一是杀菌剂，大多数都用在防治根部病害；二是杀虫剂，大多数都用在预防各类虫害，包括地下害虫以及驱避蚜虫、粉虱、螨虫等。三是生物菌剂，能大大的提升根系活性，促进生根，提高抗病性，抑制病原菌侵染；四是生根养根类产品，大多数都用在促进生根，提高根系活性和抗逆能力。
正常情况下，蘸根药剂选择生物菌剂优势更大，其持效期更长，作用更多，但要留意选择优质的生物菌产品，并正确使用。如定植时，可通过枯草芽孢杆菌、哈茨木霉菌等蘸根。而在病害较多、虫害严重等情况下，可以再一次进行选择搭配杀菌剂和杀虫剂的配方。常用的蘸根药剂有嘧菌酯、恶霉灵、精甲霜灵锰锌、噻虫嗪等。菜农在兑好药液后，将穴盘整个浸入药液中蘸湿即可，蘸根时间不能过长，以防过多的农药吸附在基质上，影响蔬菜根系的生长。蘸根后，苗子根部带药，对蔬菜的根部病害效果较好。
防治根部病害，药剂灌根是一项行之有效的措施，但一定要掌握合适的方法，否则，不但收不到应有的效果，还会有副作用。灌根药物选择要合理，一定要选择针对性强，并且防效较好的杀菌剂，不要盲目用药，以免延误防治时机，同时要尽可能地减少浪费。蔬菜定植后，若有根茎部病害发生，也能提前用枯草芽孢杆菌、哈茨木霉菌等生物菌剂喷淋茎秆，提早在根茎部建立生态防护圈，提高抗逆性，减少病原菌侵染的可能。
如已施用菌肥的棚室，不要用杀菌剂灌根防病，以防杀死菌肥中的有益微生物，使菌肥失去肥效；灌根后不宜立即浇水，如果灌根后立即浇水，会使土壤中的药液很快稀释，杀菌防病效果降低，因此，在用杀菌剂灌根后的几天内最好还是不要浇水。